Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufb9Q9CQJ8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms