Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rab5aQ9CQD1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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