Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
StambpQ9CQ26 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms