Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chmp3Q9CQ10 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms