Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Commd4Q9CQ02 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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