Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sike1Q9CPR7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms