Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scd3Q99PL7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms