Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930550L24RikQ99PA7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930550L24RikQ99PA7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms