Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramel1Q99MW3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramel1Q99MW3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms