Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Tdrd1Q99MV1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tdrd1Q99MV1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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