Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SrrtQ99MR6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SrrtQ99MR6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms