Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5rap3Q99LM2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms