Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp16Q99LG0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms