Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gps1Q99LD4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gps1Q99LD4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms