Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmp1Q99KU0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmp1Q99KU0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmp1Q99KU0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Vmp1Q99KU0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmp1Q99KU0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmp1Q99KU0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmp1Q99KU0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmp1Q99KU0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmp1Q99KU0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmp1Q99KU0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmp1Q99KU0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmp1Q99KU0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmp1Q99KU0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmp1Q99KU0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Vmp1Q99KU0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Vmp1Q99KU0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Vmp1Q99KU0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmp1Q99KU0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmp1Q99KU0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Vmp1Q99KU0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmp1Q99KU0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Vmp1Q99KU0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Vmp1Q99KU0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmp1Q99KU0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Vmp1Q99KU0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Vmp1Q99KU0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmp1Q99KU0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmp1Q99KU0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmp1Q99KU0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmp1Q99KU0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Vmp1Q99KU0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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