Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ciao1Q99KN2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ciao1Q99KN2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms