Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smim11aQ99J19 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smim11aQ99J19 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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