Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctu1Q99J10 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms