Protein–RNA interactions for Protein: Q925E0

Sntg2, Gamma-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg2Q925E0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sntg2Q925E0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms