Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim7Q923T7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms