Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn1Q922Y1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms