Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarca5Q91ZW3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms