Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpm2Q91YD4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpm2Q91YD4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms