Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp3Q91W36 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms