Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8VDP2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q8VDP2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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