Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Uhrf1Q8VDF2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Uhrf1Q8VDF2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Uhrf1Q8VDF2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Uhrf1Q8VDF2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Uhrf1Q8VDF2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Uhrf1Q8VDF2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Uhrf1Q8VDF2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Uhrf1Q8VDF2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Uhrf1Q8VDF2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Uhrf1Q8VDF2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1Q8VDF2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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