Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clptm1Q8VBZ3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms