Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ApobrQ8VBT6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms