Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT1

Txlnb, Beta-taxilin, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TxlnbQ8VBT1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TxlnbQ8VBT1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms