Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Vmn1r200Q8R281 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Vmn1r200Q8R281 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Vmn1r200Q8R281 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Vmn1r200Q8R281 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Vmn1r200Q8R281 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Vmn1r200Q8R281 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Vmn1r200Q8R281 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vmn1r200Q8R281 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Vmn1r200Q8R281 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Vmn1r200Q8R281 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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