Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Brd3Q8K2F0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms