Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hacd3Q8K2C9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd3Q8K2C9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd3Q8K2C9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd3Q8K2C9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd3Q8K2C9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd3Q8K2C9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd3Q8K2C9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd3Q8K2C9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd3Q8K2C9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd3Q8K2C9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd3Q8K2C9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd3Q8K2C9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd3Q8K2C9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd3Q8K2C9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd3Q8K2C9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd3Q8K2C9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd3Q8K2C9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd3Q8K2C9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd3Q8K2C9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hacd3Q8K2C9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hacd3Q8K2C9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms