Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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FgbQ8K0E8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FgbQ8K0E8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FgbQ8K0E8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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