Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Znf628Q8CJ78 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Znf628Q8CJ78 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Znf628Q8CJ78 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Znf628Q8CJ78 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Znf628Q8CJ78 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Znf628Q8CJ78 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Znf628Q8CJ78 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Znf628Q8CJ78 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Znf628Q8CJ78 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Znf628Q8CJ78 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Znf628Q8CJ78 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Znf628Q8CJ78 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Znf628Q8CJ78 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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