Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LgsnQ8CIX8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LgsnQ8CIX8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms