Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clip4Q8CI96 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms