Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phc3Q8CHP6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Phc3Q8CHP6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phc3Q8CHP6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms