Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG50

Rab43, Ras-related protein Rab-43, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab43Q8CG50 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rab43Q8CG50 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab43Q8CG50 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rab43Q8CG50 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rab43Q8CG50 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rab43Q8CG50 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab43Q8CG50 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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