Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp27Q8CEG8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp27Q8CEG8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp27Q8CEG8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp27Q8CEG8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp27Q8CEG8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp27Q8CEG8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp27Q8CEG8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp27Q8CEG8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms