Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEF8

Rnf222, RING finger protein 222, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf222Q8CEF8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf222Q8CEF8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf222Q8CEF8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf222Q8CEF8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf222Q8CEF8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf222Q8CEF8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf222Q8CEF8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf222Q8CEF8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf222Q8CEF8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf222Q8CEF8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf222Q8CEF8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf222Q8CEF8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms