Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc9Q8CDN9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc9Q8CDN9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc9Q8CDN9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc9Q8CDN9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc9Q8CDN9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc9Q8CDN9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc9Q8CDN9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc9Q8CDN9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc9Q8CDN9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms