Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrif1Q8CDD9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms