Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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