Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacnb2Q8CC27 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacnb2Q8CC27 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms