Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAS9

Parp9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp9Q8CAS9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Parp9Q8CAS9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Parp9Q8CAS9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Parp9Q8CAS9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Parp9Q8CAS9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Parp9Q8CAS9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Parp9Q8CAS9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Parp9Q8CAS9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Parp9Q8CAS9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Parp9Q8CAS9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms