Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aph1bQ8C7N7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Aph1bQ8C7N7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aph1bQ8C7N7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Aph1bQ8C7N7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Aph1bQ8C7N7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aph1bQ8C7N7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Aph1bQ8C7N7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Aph1bQ8C7N7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Aph1bQ8C7N7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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