Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Usp20Q8C6M1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Usp20Q8C6M1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Usp20Q8C6M1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Usp20Q8C6M1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Usp20Q8C6M1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Usp20Q8C6M1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Usp20Q8C6M1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp20Q8C6M1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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