Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5P7

Tdrp, Testis development-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdrpQ8C5P7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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TdrpQ8C5P7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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TdrpQ8C5P7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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TdrpQ8C5P7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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