Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C5C9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8C5C9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q8C5C9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms