Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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Hdac7Q8C2B3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Hdac7Q8C2B3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Hdac7Q8C2B3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Hdac7Q8C2B3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Hdac7Q8C2B3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Hdac7Q8C2B3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Hdac7Q8C2B3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Hdac7Q8C2B3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Hdac7Q8C2B3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac7Q8C2B3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Hdac7Q8C2B3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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